در طول فرآیند تولید ایمیدازول، مقداری از فاضلاب قبل از تخلیه در خارج باید تصفیه شود. فرآیند تصفیه فاضلاب به شرح زیر است: ابتدا باید یک مخزن تصفیه فاضلاب وجود داشته باشد. فاضلاب به مخزن تصفیه فاضلاب تخلیه می شود و پس از مدت معینی از واکنش شیمیایی، مواد اولیه ای که برای تولید ایمیدازول در داخل آن استفاده می شود با یکدیگر واکنش داده و برخی از مواد مضر پس از این واکنش ها از بین می روند. پس از مقدار مشخصی رسوب، برخی از مواد جامد داخل استخر به کف استخر فرو میروند و میتوانیم این مواد جامد را تمیز کنیم تا آب شفافتر شود. درمان واکنش بیشتر، آب شفاف حاوی مقدار کمی از مواد شیمیایی تولید می کند که می تواند برای حذف مواد مضر تصفیه شود. دپارتمان حفاظت از محیط زیست اکنون نیازمندی های بالایی برای آب تخلیه شده توسط تولیدکنندگان ایمیدازول دارد، بنابراین هر سازنده باید مجموعه کاملی از تجهیزات حفاظت از محیط زیست را خریداری کند.